Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfdp1O88271 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms