Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ldb2O55203 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms