Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Syngr1O55100 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms