Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn20O55082 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn20O55082 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms