Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Smarce1O54941 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms