Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DffbO54788 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DffbO54788 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DffbO54788 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffbO54788 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DffbO54788 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DffbO54788 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffbO54788 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffbO54788 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffbO54788 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffbO54788 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffbO54788 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffbO54788 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffbO54788 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DffbO54788 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffbO54788 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffbO54788 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffbO54788 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffbO54788 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffbO54788 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DffbO54788 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffbO54788 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffbO54788 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffbO54788 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffbO54788 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffbO54788 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffbO54788 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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