Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf6bO35451 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6bO35451 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms