Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt1O35449 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt1O35449 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms