Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptpn9O35239 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptpn9O35239 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms