Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe40O35185 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms