Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArxO35085 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArxO35085 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ArxO35085 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArxO35085 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ArxO35085 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArxO35085 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArxO35085 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArxO35085 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArxO35085 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ArxO35085 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ArxO35085 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ArxO35085 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ArxO35085 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ArxO35085 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ArxO35085 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ArxO35085 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArxO35085 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArxO35085 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArxO35085 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ArxO35085 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArxO35085 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArxO35085 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArxO35085 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArxO35085 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArxO35085 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArxO35085 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArxO35085 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArxO35085 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArxO35085 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArxO35085 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArxO35085 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ArxO35085 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArxO35085 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArxO35085 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArxO35085 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArxO35085 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArxO35085 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArxO35085 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArxO35085 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArxO35085 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArxO35085 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArxO35085 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ArxO35085 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArxO35085 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArxO35085 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArxO35085 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArxO35085 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ArxO35085 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArxO35085 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArxO35085 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ArxO35085 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArxO35085 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArxO35085 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArxO35085 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArxO35085 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArxO35085 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ArxO35085 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArxO35085 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArxO35085 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArxO35085 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArxO35085 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArxO35085 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ArxO35085 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArxO35085 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArxO35085 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArxO35085 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArxO35085 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArxO35085 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArxO35085 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArxO35085 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArxO35085 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArxO35085 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArxO35085 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ArxO35085 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ArxO35085 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ArxO35085 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ArxO35085 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ArxO35085 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ArxO35085 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ArxO35085 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ArxO35085 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ArxO35085 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ArxO35085 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ArxO35085 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ArxO35085 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ArxO35085 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ArxO35085 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ArxO35085 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ArxO35085 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ArxO35085 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ArxO35085 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ArxO35085 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ArxO35085 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ArxO35085 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ArxO35085 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ArxO35085 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ArxO35085 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ArxO35085 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ArxO35085 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms