Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casq1O09165 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casq1O09165 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casq1O09165 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casq1O09165 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casq1O09165 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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