Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfra2O08842 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra2O08842 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms