Protein–RNA interactions for Protein: O08790

Fpr-s1, Formyl peptide receptor-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fpr-s1O08790 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fpr-s1O08790 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fpr-s1O08790 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms