Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CckarO08786 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CckarO08786 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CckarO08786 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CckarO08786 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckarO08786 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckarO08786 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckarO08786 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckarO08786 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckarO08786 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckarO08786 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckarO08786 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckarO08786 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CckarO08786 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CckarO08786 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CckarO08786 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms