Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5458L7N219 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms