Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Speer4dL7N216 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Speer4dL7N216 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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