Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IfnabL7MTU6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms