Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vwa3bJ9JI28 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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