Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccer2J3QPU5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccer2J3QPU5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms