Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim18J3QNP2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms