Protein–RNA interactions for Protein: J3QNH3

Gm21788, Predicted gene, 21788, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21788J3QNH3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21788J3QNH3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms