Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm17577J3QNF7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm17577J3QNF7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm17577J3QNF7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm17577J3QNF7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm17577J3QNF7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms