Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm21818J3KMS6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm21818J3KMS6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm21818J3KMS6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm21818J3KMS6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm21818J3KMS6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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