Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pot1bH7BX60 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pot1bH7BX60 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms