Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp17lcG5E8I7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp17lcG5E8I7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp17lcG5E8I7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp17lcG5E8I7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp17lcG5E8I7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp17lcG5E8I7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp17lcG5E8I7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp17lcG5E8I7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp17lcG5E8I7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp17lcG5E8I7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp17lcG5E8I7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp17lcG5E8I7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp17lcG5E8I7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp17lcG5E8I7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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