Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nccrp1G3X9C2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms