Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC33■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
BicraF8VPZ9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BicraF8VPZ9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms