Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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