Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Farp1F8VPU2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms