Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3443F7CCV5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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