Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms