Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Crocc2F6XLV1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Crocc2F6XLV1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms