Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc74aE9Q9U8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms