Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9N3

Vmn1r152, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r152E9Q9N3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r152E9Q9N3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms