Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc146E9Q9F7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms