Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Gm5407E9Q7Q1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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Gm5407E9Q7Q1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gm5407E9Q7Q1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gm5407E9Q7Q1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gm5407E9Q7Q1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gm5407E9Q7Q1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gm5407E9Q7Q1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm5407E9Q7Q1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm5407E9Q7Q1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm5407E9Q7Q1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm5407E9Q7Q1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm5407E9Q7Q1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm5407E9Q7Q1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm5407E9Q7Q1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5407E9Q7Q1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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