Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BC005561E9Q5E2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BC005561E9Q5E2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms