Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
8030474K03RikE9Q4Y8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
8030474K03RikE9Q4Y8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms