Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms