Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt78E9Q0F0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt78E9Q0F0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms