Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph10bE9PYQ0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms