Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn4E9PX29 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms