Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms