Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L6

Slc18b1, MFS-type transporter SLC18B1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18b1D3Z5L6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18b1D3Z5L6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18b1D3Z5L6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms