Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm4871D3Z0W7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4871D3Z0W7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms