Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms