Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc6D3YZP9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms