Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samd1D3YXK1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Samd1D3YXK1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms