Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn24D3YXJ9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms